Formations passées


Ecoles chercheurs/Ateliers


Métabolomique quantitative par spectrométrie de masse

Environnement : francophone
Objectif : L’objectif de ce stage est d’apporter les connaissances fondamentales et pratique pour quantifier des métabolites ed facon relative ou absolue par spectrométrie de masse dans un contexte d’approche métabolomique.
Public : Ce stage s’adresse à des techniciens supérieurs, ingénieurs et chercheurs
Nombre de participants : 3 à 6 personnes
Durée : 3 journée / 19h
Tarifs : 1310€/personnes
Date et lieu de la prochaine session : semaine du 13 novembre du  2017 et sur demande pour groupe supérieur à 3. Toulouse
Programme :
COURS THÉORIQUES (1,5 JOURS) :
1.Introduction au métabolome
2. Fondements en spectrométrie de masse pour l’analyse des petites molécules: Instrumentation / Stratégie d’identification/ Stratégie de quantification Techniques de couplage (GC-MS, LC-MS, CE-MS)
3. Stratégies d’analyse du métabolome et applications
TRAVAUX PRATIQUES (1,5 JOURS)
-Quantification des métabolites intracellulaires d’Escherichia coli : Préparation des échantillons / Techniques d’extraction / Quenching
--Analyse par couplage IC-MS/MS
Quantification par dilution isotopique généralisée (IDMS)
-Traitement des données
Contact : floriant.bellvert@insa-toulouse.fr
Site web :  INSA Toulouse formation
Sponsors : INSA toulouse et MetaToul

Semaine du 13 Novembre 2017

L’Ecole Chercheurs “Toulouse School of Lipids”

"Toulouse School of Lipids” 
Lieu: Toulouse, France

27 au 29 Janvier 2016

12èmes Conférence Internationale de la Société métabolomique

Workshop: Computational Workflows and Workflow Engines: Monday 27th June 2016 - 13:30 - 15:00
Organisers: Mark Viant, Ralf Weber, Warwick Dunn, Pablo Moreno, Reza Salek, Christoph Steinbeck and the PhenoMeNal consortium
Lieu: Dublin, Ireland

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27 au 30 juin 2016

Spectrométrie de Masse

"Implémenter un système qualité dans un laboratoire de spectrométrie de masse"
Mardi 27 septembre 2016, de 13h00 à 17h00
Organisation et animation: Brice Bouyssiere (Université de Pau et des Pays de l'Adour):
Intervenants: I. Schmitz (Univ. Rouen), J. Widart (Univ. Liège, MS Expertise), H. Paucot (Formation & Conseil UT2A).
Lieu: Centre de congrès Cité Mondiale, 20 Quai des Chartrons, 33000 Bordeaux, France. Salle "Brasilia" (niv. -1)

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27 au 30 Septembre 2016

Lipidomique

- "Imagerie des lipides par spectrométrie de masse" et cours: "Analyseurs de masse: principes de fonctionnement, caractéristiques et performances": Jeudi 27 Octobre 2016
- "Validation de méthode et quantification de lipides complexes": Vendredi 28 Octobre 2016
Lieu: Campus scientifique de Rangueil, Toulouse, France
Contact: Justine Bertrand-Michel: justine.bertrand-michel@inserm.fr

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23 au 26 Octobre 2016

Spectrométrie de Masse et analyse de spectres

Formateur: Jean-Claude Tabet, Professeur émérite UPMC-SORBONNE UNIVERSITES
Organisée par la Plateforme Métabolome de Bordeaux – MetaboHUB: http://www.cgfb.u-bordeaux2.fr/fr/metabolomeLieu: Salle Virologie, bâtiment IBVM, Centre INRA de Bordeaux, 71 avenue Edouard Bourlaux, 33140 Villenave d'Ornon, France
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17 au 20 Octobre 2016

Métabolomique, outils et méthodologies

Environnement : francophone
Objectif : Formation intra CNRS pour besoins en local
Public : chercheurs, ingénieurs et technicien des laboratoires du site / région
Nombre de participants : 15-20
Durée : 3 jours
Tarifs : Intra CNRS
Date et lieu de la prochaine session : non programmée
Programme :
Jours 1 & 2 :
Introduction, Développement d’un projet, Les outils de l’analyse : RMN, LC & GC/MS, Les outils de l’interprétation : Galaxy4metabolomics, statistiques théoriques et appliquées, Conclusion
Jour 3 :
Introduction, Les principaux verrous, Traitement avancé du signal et des données, Intégration des données en réseaux métaboliques, Conclusion
Contact : C. Jousse (UBP, Clermont-Ferrand)
Site web : non
Sponsors : CNRS, UBP, FRE

"Sur demande"

L’Ecole Chercheurs "Data processing, analysis and annotation with the online Workflow4metabolomics computational infrastructure"

"Data processing, analysis and annotation with the online Workflow4metabolomics computational infrastructure" 
Lieu: Roscoff, France

21 au 25 Septembre 2015

L’Ecole Chercheurs “Challenge and progress in the annotation and identification of de novo small molecules of biological origin”

“Challenge and progress in the annotation and identification of de novo small molecules of biological origin”
Lieu: Gif sur Yvette, France

23 au 24 Octobre 2014

L’Ecole chercheurs “The “Mass spectrometry and metabolomics, from the design of experiments to data integration in metabolic networks”

"Mass spectrometry and metabolomics, from the design of experiments to data integration in metabolic networks”
Lieu: La Colle sur Loup, France

6 au 10 Octobre 2014

L’Ecole Chercheurs “FT-MS analysis and food and environmental toxicology”

“FT-MS analysis and food and environmental toxicology” 
Lieu: Clermont-Ferrand, France

31 Mars au 4 Avril 2014

Formation « 13C-fluxomique appliquée aux cellules cancéreuses »

FORMATION: 13C-FLUXOMIQUE APPLIQUÉE AUX CELLULES CANCÉREUSES
Cette formation a pour objectif l’acquisition de connaissances théoriques et pratiques de l’analyse des systèmes métaboliques par des approches de fluxomique appliquée au domaine du cancer.
- Date: du 13 au 16 nov. 2018
- Durée du stage : 4 jours – 30 heures
Plus de renseignement: Télécharger le fichier

Journées Lipidomystes

Journées Lipidomystes
Lieu: LYON
Date: 25 et 26 octobre 2018

Nous parlerons de préparation d'échantillons, de lipidomique globale, de traitement de données, de biophysique des membranes et de RMN...

Voici le lien pour vous inscrire : https://lipidomystes.sciencesconf.org/

Comme chaque année vous êtes les bienvenus pour faire des petites présentations techniques dans les thématiques proposées, n'hésitez pas à vous lancer!

Workshop "Analyse et interprétation des données en protéomique et métabolomique : points communs et spécificités"

Organisée conjointement par le R.F.M.F. - Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, la S.F.E.A.P. - Société Française d’Electrophorèse et Analyse Protéomique, ProFI - Infrastructure nationale de protéomique et MetaboHUB - Infrastructure nationale de métabolomique et fluxomique: https://www.forumlabo.com/ForumlaboLyon/conference.php
La protéomique et la métabolomique sont deux sciences "omiques" complémentaires pour l'étude du vivant et la médecine personnalisée, qui partagent notamment une technique analytique commune : la spectrométrie de masse. Nous sommes heureux de vous accueillir à ce workshop qui est constitué de deux parties visant à présenter un état de l'art sur l'analyse et l'interprétation des données dans chaque discipline, et à faire émerger des axes thématiques transverses. https://framaforms.org/workshop-analyse-et-interpretation-des-donnees-en-proteomique-et-metabolomique-points-communs-et

Date : Mercredi 28 mars 2018

Lieu : Forum Labo (Centre de congrès de Lyon)

HALLS 4/5/6 - ENTREE B
50 Quai Charles de Gaulle - 69463 Lyon cedex 06
Infos pratiques : https://www.forumlabo.com/ForumlaboLyon/infos.php

Intensive course at Tsukuba University (Japan) and Pontifical Catholic University of Chili

The following intensive course has been held on February 26th - March 2nd 2018 at Tsukuba University (Japan) and from March 22nd -March 27th 2018 at Pontifical Catholic University of Chili.

Subject name:Metabolomics: an emerging but powerful tool to study biology

Lecturer:Dr. Dominique Rolin (Professor, University of Bordeaux)

Credit:1.0 Credit

Room:F106 seminar room, Institute of Biological Agricultural Science building

Summary:In the post-genomics era, metabolomics represents a new «  omics tool » that in the last decade has received increased attention in many biological fields such as white and green biotechnology, nutrition, plant physiology, microbiology, etc. Metabolomics is based on the holistic study of the metabolic profile that characterizes a specific phenotype in a biological system. This course is going to give an overview on metabolomics approach in biology and will present the technological diversity to carry out metabolic. 

Lecture schedule:

26-Feb.    Introduction to functional genomic & metabolomics

27-Feb.    Metabolomics and its workflow

28-Feb.    NMR as analytical tool

1-Mar.      LC-MS and GC-MS as analytical tools

2-Mar       Examples of application

Toulouse School of Lipids 2018

La Toulouse School of Lipids s'est déroulée les 29-30 et 31 janvier 2018 en français.

L’objectif de cet enseignement est de donner aux participants les bases des connaissances sur les lipides, leur diversité, leurs biosynthèses et leurs rôles mais également de les familiariser avec les méthodes d’étude moderne de lipidomique. Les aspects les plus actuels de la recherche sur les grandes familles de lipides et leur implication en pathologie humaine seront abordés Télécharger le programme

License 3 Sciences de la vie (Projet Scientifique en Anglais)

Lieu : Uni Bordeaux
Date : 01/01/2019
Nombre d'étudiants : 40
Nom du formateur : P Pétriacq
Nom de la Plateforme : MTH-Bordeaux

Master Biochimie et Bio Mol (Lipidomique)

Lieu : Uni Bordeaux
Date : 09/2019
Nombre d'étudiants : 15
Nom du formateur : L Fouillen
Nom de la Plateforme : MTH-Bordeaux

Master 2 B2AS (Plant Cell Metabolism)

Lieu : Uni Bordeaux
Date : 10/2019
Nombre d'étudiants : 9
Nom du formateur : P Pétriacq
Nom de la Plateforme : MTH-Bordeaux

Master 2 Phytochimie

Lieu : Uni Bordeaux
Date : 4/11/2019
Nombre d'étudiants : 10
Nom du formateur : P Pétriacq
Nom de la Plateforme : MTH-Bordeaux

Master 2 GIP-TRIAD (IOB)

Lieu : Uni Bordeaux
Date : 4/11/2019
Nombre d'étudiants : 10 et 11/ 2019
Nom du formateur : D Rolin, P Pétriacq
Nom de la Plateforme : MTH-Bordeaux

Master 1 Microbiologie (mutualisé)

Lieu : UCA
Date : sept-nov 2019
Nombre d'étudiants : 40
Nom du formateur : AM Delort, B Diémé, B Lyan, M Traïkia, M Hébraud, C Jousse
Nom de la Plateforme : MTH-Clermont-Ferrand

Master Uiversité de Tsukuba

Lieu : Uni Bordeaux
Date : 01/01/2019
Nombre d'étudiants : 8
Nom du formateur : D Rolin
Nom de la Plateforme : MTH-Bordeaux

Master 1 Biologie-santé (mutualisé)

Lieu : UCA
Date : sept-nov 2019
Nombre d'étudiants : 10
Nom du formateur : AM Delort, B Diémé, B Lyan, M Traïkia, M Hébraud, C Jousse
Nom de la Plateforme : MTH-Clermont-Ferrand

Master 1 Bioinformatique (mutualisé)

Lieu : UCA
Date : sept-nov 2019
Nombre d'étudiants : 15
Nom du formateur : AM Delort, B Diémé, B Lyan, M Traïkia, M Hébraud, C Jousse
Nom de la Plateforme : MTH-Clermont-Ferrand

Master 2 Microbiologie

Lieu : UCA
Date : oct. 2019
Nombre d'étudiants : 30
Nom du formateur : AM Delort, C Jousse
Nom de la Plateforme : MTH-Clermont-Ferrand

Master 2 Bioinformatique

Lieu : UCA
Date : nov-dec 2019
Nombre d'étudiants : 10
Nom du formateur : C Jousse
Nom de la Plateforme : MTH-Clermont-Ferrand

Master 2 bioingienérie

Lieu : UPS
Date : 4/11/2019
Nombre d'étudiants : 30
Nom du formateur : L Debrauwer
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Master 2 bioingienérie

Lieu : UPS
Date : 4/11/2019
Nombre d'étudiants : 30
Nom du formateur : C Canlet
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Master 2 Toxicologie humaine, évaluation des risques et vigilance

Lieu :Univ Paris-Descartes
Date : 5/11/2019
Nombre d'étudiants : 12
Nom du formateur : L Debrauwer
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Licence 3

Lieu : UPS
Date : 1/3/2019
Nombre d'étudiants : 71
Nom du formateur : C Berges
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Master 2 MSB2

Lieu : UPS
Date : 1/9/2019
Nombre d'étudiants : 12
Nom du formateur : F Bellvert
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Master 2 bioingienérie

Lieu : UPS
Date : 01/10/2019
Nombre d'étudiants : 30
Nom du formateur : F Bellvert
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Master 2 Microbio-Santé

Lieu : Université de Lyon
Date : 11/2019
Nombre d'étudiants : 40
Nom du formateur : F Bellvert
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Master 1 BBT

Lieu : UPS
Date : 03/2019
Nombre d'étudiants : 11
Nom du formateur : E Cahoreau
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Master 2 MSB2

Lieu : UPS
Date : 2-3/12/2019
Nombre d'étudiants : 11
Nom du formateur : E Cahoreau
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Master 2 bioingienérie

Lieu : UPS
Date : 3/11/2019
Nombre d'étudiants : 30
Nom du formateur : P Le Faouder
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Master 2 bioingienérie

Lieu : UPS
Date : 3/11/2019
Nombre d'étudiants : 30
Nom du formateur : J Bertrand-Michel
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Master 2 OMIC

Lieu : Paris 6
Date : 1/11/2019
Nombre d'étudiants : 16
Nom du formateur : J Bertrand-Michel
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Master 2 MSB2

Lieu : UPS
Date : 25/9/2019
Nombre d'étudiants : 12
Nom du formateur : J Bertrand-Michel
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Master 2 Biologie végétale

Lieu : UPS
Date : 7/10/2019
Nombre d'étudiants : 35
Nom du formateur : S Fournier
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Master 2 Biologie végétale

Lieu : UPS
Date : 17-21/10/2019
Nombre d'étudiants : 35
Nom du formateur : S Diarrassouba; J Chervin; V Puech-Pages; S Fournier
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Master 2 bioingienérie

Lieu : UPS
Date : 5/11/2019
Nombre d'étudiants : 30
Nom du formateur : S Fournier
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

BTS Anabiotech Auzeville

Lieu : LRSV-Toulouse
Date : 14/11/2019
Nombre d'étudiants : 15
Nom du formateur : S Fournier
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

DU Plantes à Valeur Santé/ Master 1 B2AS

Lieu : Uni Bordeaux
Date : 7-10/10/2019
Nombre d'étudiants : 18
Nom du formateur : P Pétriacq, J Valls
Nom de la Plateforme : MTH-Bordeaux

Systems Immunology

Lieu : Sorbonne université
Date : 27/11/2019
Nombre d'étudiants : 18
Nom du formateur : E Thévenot
Nom de la Plateforme : MTH-Saclay

DU Bioinformatique intégrative (DUBii)

Lieu : Univ Paris
Date : 19/2/2019
Nombre d'étudiants : 17
Nom du formateur : F Jourdan
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Journée thématique sur les autorités des données (FAIR)

Lieu : Toulouse
Date : 8/4/2019
Nombre d'étudiants : 100
Nom du formateur : D Jacob
Nom de la Plateforme : MTH-Bordeaux

GERM (traitement données RMN)

Lieu : Ile d'Oléron
Date : 26-29/05/2019
Nombre d'étudiants : 30
Nom du formateur : D Jacob
Nom de la Plateforme : MTH-Bordeaux

R-applications

Lieu : MNHN-UPMC, Paris
Date : 16/5/2019
Nombre d'étudiants : 20
Nom du formateur : D Jacob
Nom de la Plateforme : MTH-Bordeaux

Metabolomics Workshop: From Study Design to Metabolite Annotation

Lieu : Pretoria, Afrique du sud
Date : 11-15/03/2019
Nombre d'étudiants : 25
Nom du formateur : F Jourdan
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

IBPS Summer School on Endocrine Distruptors

Lieu : Paris
Date : 27/8/2019
Nombre d'étudiants : 10
Nom du formateur : F Jourdan
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

EMBO Practical Course on Metabolomics Bioinformatics for Life Scientists

Lieu : Lyon
Date : 16-20/09/2019
Nombre d'étudiants : 25
Nom du formateur : F Jourdan; J Bertrand-Michel
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Flux Cancer

Lieu : Toulouse
Date : 8-11/10/2019
Nombre d'étudiants : 11
Nom du formateur : JC Portais; JE Sarry; L Stuani; M Heuillet; C Berges; N Butin; J Bertrand-Michel; A Tournadre; E Cahoreau; F Bellvert; F Jourdan; N Poupin
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Lipidomic course

Lieu : Pretoria, Afrique du sud
Date : 11-15/03/2019
Nombre d'étudiants : 25
Nom du formateur : J Bertrand-Michel
Nom de la Plateforme : MTH-Toulouse

Ecole mixte CHEMOMICS

Lieu : Sète
Date : 18-21/11/2019
Nombre d'étudiants : 38
Nom du formateur : F Giacomoni, M Tremblay-Franco
Nom de la Plateforme : MTH-Clermont-Ferrand, MTH-Toulouse

Mass spectrometry: LC-MS analysis

Lieu : GTN training material
Date de mise à disposition : 06/2019
Nombre de consultations : 
Nom du formateur : M Pétéra
Nom de la Plateforme : MTH-Clermont-Ferrand


e-MetaboHUB: W4M, MetExplore, NMRProcFlow, PeakForest


MetExplore

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Traitement des données métabolomiques, analyse et annotation avec Galaxy - Workflow4Metabolomics

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