Equipements disponibles

Principaux équipements disponibles

Utilisation des robots pour la préparation des échantillons à haut débit

          






            

- MTH-Bordeaux:
2 plateformes robotisée pour le phénotypage à haut débit,
1 Robot titration pH (Bruker)

-MTH-Toulouse:
2 Robots TECAN Evo 200 de Culture et préparation d'échantillons
2 Robots TECAN Fluent

- MTH-Clermont:
1 robot Freedom EVO 200 Tecan                                                                 

Laboratoire de RMN, service et solutions RMN faisant appel à des couplages analytiques multi-techniques

L’expertise de MetaboHUB concerne la RMN liquide à haute résolution et la RMN HR-MAS ainsi que le couplage de techniques analytiques associant la MS et la chromatographie.
L’infrastructure MetaboHUB dispose de cinq aimants RMN, allant de 500 à 800 MHz, certains utilisant une cryosonde pour améliorer la sensibilité.
Le personnel technique et scientifique réalisera des expérimentations de RMN pour vos projets (dans le cadre de prestations ou de collaborations) ou vous aidera à développer des méthodes spécifiques à vos besoins. Plusieurs spectromètres et leurs laboratoires attenants sont accessibles pour une utilisation directe par des scientifiques expérimentés en RMN.
Il est possible de réaliser des acquisitions RMN 1D et 2D sur des échantillons liquides et des expériences HR-MAS à partir de tissus ou d’autres échantillons biologiques solides. Pour des mélanges complexes particuliers / objectifs singuliers, il est possible de réaliser à façon des expérimentations de LC-RMN.
L’automatisation de la préparation des échantillons jusqu’aux analyses permet de proposer des analyses de RMN à haut-débit. Reliée à notre laboratoire de bioinformatique, une analyse in-silico assurera un traitement robuste des données.

MTH-Bordeaux:
- 500 MHz Avance III Bruker with its environment and cryoprobe
- 600 MHz Avance III Bruker with its environment (Including LC-SPE_NMR)
MTH-Toulouse:
- 500 Ultrashiel Avance II,
-600 Bruker Avance IIIHD
- 800 Ascend Avance III,
MTH-Clermont Ferrand:
- AVANCE III Ultrashield NMR spectrometer equipped with a cryoprobe (Bruker)
MTH-Nantes:
-700 MHz AVANCE III HD Bruker equipped with a 1H/13C/15N/2H cryoprobe
-500 MHz AVANCE III Bruker equipped with an inverse 1H/13C/BB grad-Z 5mm probe ; a micro-imaging X,Y,Z-grad probe ; and a flow equipment for real time monitoring
-400 MHzAVANCE NEO Bruker equipped with a BBFO Prodigy grad-z cryoprobe
-Bruker d-DNP polariser prototype 7,05 T Solid-state low temperature probe for DNP with cross-polarization 1H/13C; Magnetic tunnel
-400 MHz Pulse RS²D console - Bruker magnet 7,05 T DUAL+ 1H/13C ATMA grad-Z 5mm probe
-400 MHz Avance III Bruker BBFO ATMA grad 5mm probe
-300 MHz Avance I Bruker BBFO ATMA grad-Z 5mm probe
-2 benchtop spectrometers: Magritek Spinsolve 1H/19F 43 MHz gradient ; Magritek Spinsolve 1H/13C 43 MHz gradient ; equipped with flow systems


 
 

Appareillage MS

- MTH-Paris: UHPLC-Q-Exactive (Thermo Fisher Scientific), UHPLC-Q-Exactive+ (Thermo Fisher Scientific), UHPLC-Exactive (Thermo Fisher Scientific), UHPLC-Orbitrap Fusion Tribrid (Thermo Fisher Scientific), UHPLC-Q-TOF Impact HD (Bruker), UHPLC-Tims-TOF (Bruker), UPLC-Xevo TQS (Waters), UPLC-Xevo TQMS (Waters), UPLC-QuattroTQMS (Waters)

- MTH-Bordeaux: UHPLC-QTRAP 5500 (ABSciex); UHPLC-QTRAP 6500 (ABSciex); UHPLC-Orbitap (Thermo); 2 GC-MS (Agilent); 1 LC-IT (Bruker); 1 UHPLC-QQQ (Thermo);1 UHPLC-Qexactive (Thermo); 1 LC-MS-microTOF (Bruker), TLC-MS (Camag)

- MTH-Toulouse:UPLH-LTQ Orbitrap (Termo, UPLC-Vantage (Termo, UPLH-Quantum (Thermo), UPLC-MS QTOF SynaptG2Si (Waters), LC-MS Q Exactive Plus (Termo), LC-MS QTRAP 5500 (Sciexx), LC-MS XevoG2-XS (Waters), LC-MS-LTQ Orbitrap Velos (Thermo), ICS-MS-QExative PLus (Thermo), LC-MS QqQ 6460 (Agilent), LC/UPC2-MS QTOF Xevo G2 XS (Waters), LC-MS-Exactive (Thermo), MicroLC-MS QqQ 8060 (Shimadzu), GC-MS TSQ Quantum (Thermo), GC-MS ISQ (Thermo), GC-MS TSQ (Thermo)

- MTH-Clermont Ferrand: GC-MS 5975 et 7890B (Agilent), GC-MS/MS Quattro Micro (Waters), GC-c-IRMS Isoprime (GV Instruments), GC-QToF 7200B (Agilent), LC-MS Quattro Micro (Waters), LC-MS 5500 QTRAP (ABSciex), LC-QToF Impact HD2 et TimsToF (Bruker), LTQ Orbitrap Velos (Thermo Fisher Scientific)


Laboratoire de GC-MS et service

Le laboratoire de service en GC-MS fournit des prestations d’acquisition de données utilisant la GC couplée à des méthodes de spectrométrie de masse faible ou haute résolutions. Le laboratoire dispose de plusieurs instruments de spectrométrie de masse équipés de sources de type ionisation électronique (EI) et ionisation chimique (CI), avec des analyseurs de type simple quadrupôle, triple quadrupôle, à secteur magnétique (IRMS), et à temps de vol (Q-Tof).
Les atouts du laboratoire sont :
  • sa capacité à traiter un large spectre de matrices biologiques avec des méthodes de préparations d'échantillons adaptées,
  • la possibilité d'acquérir des données à partir d'une large gamme d'instruments de GC-MS,
  • l’offre de méthodes GC-MS complémentaires pouvant être appliquées à la fois en lipidomique (analyse d’acides gras), en fluxomique, pour des approches de métabolomique ciblées et non ciblées, ainsi que pour des études structurales pour l’identification de métabolites.
 
 
 

Laboratoire de LC-MS et service

Le laboratoire de service en LC-MS fournit des services d’acquisition de données en utilisant la chromatographie liquide couplée à des méthodes de spectrométrie de masse haute résolution (HRMS). Le laboratoire comprend différents types d’instruments de spectrométrie de masse comme des Q-ToF, LTQ-Orbitrap, Exactive, Q-Exactive et FTICR-MS. La couverture optimale du métabolome peut être réalisée par la mise en œuvre de différentes méthodes de spectrométrie de masse en injection directe (MS) ou avec des couplages de chromatographie (LC-MS). Ces méthodes analytiques sont capables de détecter une grande diversité structurale de métabolites.

Les atouts de ce laboratoire sont : 
  • sa capacité à traiter un large spectre de matrices biologiques avec des méthodes de préparations d'échantillons adaptées,
  • la possibilité d’acquérir des données à partir d’une large gamme d’outils de HRMS et de LC-MS,
  • la disponibilité de méthodes complémentaires d’introduction directe-MS et de LC-MS permettant de réaliser le profilage de métabolites de très haute à moyenne polarité.
 




Principaux équipements disponibles

Utilisation des robots pour la préparation des échantillons à haut débit

          






            

- MTH-Bordeaux:
2 plateformes robotisée pour le phénotypage à haut débit,
1 Robot titration pH (Bruker)

-MTH-Toulouse:
2 Robots TECAN Evo 200 de Culture et préparation d'échantillons
2 Robots TECAN Fluent

- MTH-Clermont:
1 robot Freedom EVO 200 Tecan                                                                 

Laboratoire de RMN, service et solutions RMN faisant appel à des couplages analytiques multi-techniques

L’expertise de MetaboHUB concerne la RMN liquide à haute résolution et la RMN HR-MAS ainsi que le couplage de techniques analytiques associant la MS et la chromatographie.
L’infrastructure MetaboHUB dispose de cinq aimants RMN, allant de 500 à 800 MHz, certains utilisant une cryosonde pour améliorer la sensibilité.
Le personnel technique et scientifique réalisera des expérimentations de RMN pour vos projets (dans le cadre de prestations ou de collaborations) ou vous aidera à développer des méthodes spécifiques à vos besoins. Plusieurs spectromètres et leurs laboratoires attenants sont accessibles pour une utilisation directe par des scientifiques expérimentés en RMN.
Il est possible de réaliser des acquisitions RMN 1D et 2D sur des échantillons liquides et des expériences HR-MAS à partir de tissus ou d’autres échantillons biologiques solides. Pour des mélanges complexes particuliers / objectifs singuliers, il est possible de réaliser à façon des expérimentations de LC-RMN.
L’automatisation de la préparation des échantillons jusqu’aux analyses permet de proposer des analyses de RMN à haut-débit. Reliée à notre laboratoire de bioinformatique, une analyse in-silico assurera un traitement robuste des données.

MTH-Bordeaux:
- 500 MHz Avance III Bruker with its environment and cryoprobe
- 600 MHz Avance III Bruker with its environment (Including LC-SPE_NMR)
MTH-Toulouse:
- 500 Ultrashiel Avance II,
-600 Bruker Avance IIIHD
- 800 Ascend Avance III,
MTH-Clermont Ferrand:
- AVANCE III Ultrashield NMR spectrometer equipped with a cryoprobe (Bruker)
MTH-Nantes:
-700 MHz AVANCE III HD Bruker equipped with a 1H/13C/15N/2H cryoprobe
-500 MHz AVANCE III Bruker equipped with an inverse 1H/13C/BB grad-Z 5mm probe ; a micro-imaging X,Y,Z-grad probe ; and a flow equipment for real time monitoring
-400 MHzAVANCE NEO Bruker equipped with a BBFO Prodigy grad-z cryoprobe
-Bruker d-DNP polariser prototype 7,05 T Solid-state low temperature probe for DNP with cross-polarization 1H/13C; Magnetic tunnel
-400 MHz Pulse RS²D console - Bruker magnet 7,05 T DUAL+ 1H/13C ATMA grad-Z 5mm probe
-400 MHz Avance III Bruker BBFO ATMA grad 5mm probe
-300 MHz Avance I Bruker BBFO ATMA grad-Z 5mm probe
-2 benchtop spectrometers: Magritek Spinsolve 1H/19F 43 MHz gradient ; Magritek Spinsolve 1H/13C 43 MHz gradient ; equipped with flow systems


 
 

Appareillage MS

- MTH-Paris: UHPLC-Q-Exactive (Thermo Fisher Scientific), UHPLC-Q-Exactive+ (Thermo Fisher Scientific), UHPLC-Exactive (Thermo Fisher Scientific), UHPLC-Orbitrap Fusion Tribrid (Thermo Fisher Scientific), UHPLC-Q-TOF Impact HD (Bruker), UHPLC-Tims-TOF (Bruker), UPLC-Xevo TQS (Waters), UPLC-Xevo TQMS (Waters), UPLC-QuattroTQMS (Waters)

- MTH-Bordeaux: UHPLC-QTRAP 5500 (ABSciex); UHPLC-QTRAP 6500 (ABSciex); UHPLC-Orbitap (Thermo); 2 GC-MS (Agilent); 1 LC-IT (Bruker); 1 UHPLC-QQQ (Thermo);1 UHPLC-Qexactive (Thermo); 1 LC-MS-microTOF (Bruker), TLC-MS (Camag)

- MTH-Toulouse:UPLH-LTQ Orbitrap (Termo, UPLC-Vantage (Termo, UPLH-Quantum (Thermo), UPLC-MS QTOF SynaptG2Si (Waters), LC-MS Q Exactive Plus (Termo), LC-MS QTRAP 5500 (Sciexx), LC-MS XevoG2-XS (Waters), LC-MS-LTQ Orbitrap Velos (Thermo), ICS-MS-QExative PLus (Thermo), LC-MS QqQ 6460 (Agilent), LC/UPC2-MS QTOF Xevo G2 XS (Waters), LC-MS-Exactive (Thermo), MicroLC-MS QqQ 8060 (Shimadzu), GC-MS TSQ Quantum (Thermo), GC-MS ISQ (Thermo), GC-MS TSQ (Thermo)

- MTH-Clermont Ferrand: GC-MS 5975 et 7890B (Agilent), GC-MS/MS Quattro Micro (Waters), GC-c-IRMS Isoprime (GV Instruments), GC-QToF 7200B (Agilent), LC-MS Quattro Micro (Waters), LC-MS 5500 QTRAP (ABSciex), LC-QToF Impact HD2 et TimsToF (Bruker), LTQ Orbitrap Velos (Thermo Fisher Scientific)


Laboratoire de GC-MS et service

Le laboratoire de service en GC-MS fournit des prestations d’acquisition de données utilisant la GC couplée à des méthodes de spectrométrie de masse faible ou haute résolutions. Le laboratoire dispose de plusieurs instruments de spectrométrie de masse équipés de sources de type ionisation électronique (EI) et ionisation chimique (CI), avec des analyseurs de type simple quadrupôle, triple quadrupôle, à secteur magnétique (IRMS), et à temps de vol (Q-Tof).
Les atouts du laboratoire sont :
  • sa capacité à traiter un large spectre de matrices biologiques avec des méthodes de préparations d'échantillons adaptées,
  • la possibilité d'acquérir des données à partir d'une large gamme d'instruments de GC-MS,
  • l’offre de méthodes GC-MS complémentaires pouvant être appliquées à la fois en lipidomique (analyse d’acides gras), en fluxomique, pour des approches de métabolomique ciblées et non ciblées, ainsi que pour des études structurales pour l’identification de métabolites.
 
 
 

Laboratoire de LC-MS et service

Le laboratoire de service en LC-MS fournit des services d’acquisition de données en utilisant la chromatographie liquide couplée à des méthodes de spectrométrie de masse haute résolution (HRMS). Le laboratoire comprend différents types d’instruments de spectrométrie de masse comme des Q-ToF, LTQ-Orbitrap, Exactive, Q-Exactive et FTICR-MS. La couverture optimale du métabolome peut être réalisée par la mise en œuvre de différentes méthodes de spectrométrie de masse en injection directe (MS) ou avec des couplages de chromatographie (LC-MS). Ces méthodes analytiques sont capables de détecter une grande diversité structurale de métabolites.

Les atouts de ce laboratoire sont : 
  • sa capacité à traiter un large spectre de matrices biologiques avec des méthodes de préparations d'échantillons adaptées,
  • la possibilité d’acquérir des données à partir d’une large gamme d’outils de HRMS et de LC-MS,
  • la disponibilité de méthodes complémentaires d’introduction directe-MS et de LC-MS permettant de réaliser le profilage de métabolites de très haute à moyenne polarité.