Nom des responsables de la structure
- Alain Bouchereau, Prof. Univ. Rennes 1 Michel Krempf, Prof. Univ. Nantes
Tutelles de la structure
- INRA , CNRS, Univ. Nantes, Univ. Rennes 1, Univ. Angers, Univ. Bretagne Occidentale, UPMC, Agrocampus Ouest, Oniris, INSERM
Personne référent pour les échanges avec MetaboHUB
- Alain Bouchereau
Site géographique
- Angers, Brest, Nantes, Rennes-Le Rheu, Roscoff
Adresse du site web
Domaine d’application
Mer, Agroressources, Santé, Environnement
Services types
Métabolomique, Profilages métaboliques ciblés et non ciblés, Analyses structurales, Fluxomique, Chimiométrie
Capacité analytique avec le type de techniques maitrisées
La plateforme CORSAIRE est en mesure de prendre en charge des prélèvements biologiques de natures diversifiées (fluides biologiques, gaz, tissus, extraits) d’origines biologiques variées (microbienne, animale, végétale) provenant d’environnements marin, terrestre, sauvage, d’élevage ou de culture. Les prestations proposées sont multiples : approches globales, approche ciblées, approches dynamiques (fluxomique).
La plateforme dispose des compétences nécessaires et de l’organisation adaptée pour assurer la prise en charge normalisée des demandes d’analyses, leur réalisation et la délivrance des rapports d’exécution.
Les compétences analytiques sont principalement basées sur la maîtrise de techniques extractives diversifiées (liquide, SPE, SPME,…) de techniques séparatives variées basées sur des systèmes de chromatographie liquides ou gazeuses et de techniques de détections variées (Vis, UV, Fluo, réfracto, spectrométrie de masse, RMN). Différentes configurations de spectromètres de masse à basse et haute résolutions sont disponibles. Les spectromètres de RMN sont de champs variables et équipés de sondes diversifiées.
CORSAIRE, en partenariat avec la plateforme ABIMS a contribué au développement des outils de retraitements des données sous Galaxy aussi bien pour la spectrométrie de masse que pour la RMN
Liste des équipements
Quelques-uns des principaux instruments disponibles sur la plateforme sont listés ci-après:
RMN , AVANCE III 500 BRUCKER
RMN , AVANCE 400 BRUCKER
RMN ASCEND 700 MHz BRUKER
DRX 300 BRUKER (sonde 5mm Quattro 1H/13C/31P/19F et sonde BBO 10 mm).
Avance 400 BRUKER (Dual 5 mm 1H/13C et sonde 5 mm inverse TBI 1H/{BB}/31P).
Avance III HD 500 BRUKER (sonde 5 mm inverse TBI 1H / {BB}/13C, sonde 5 mm inverse TXI 1H/13C/31P, sonde inverse 5 mm TXO 1H/19F/13C et deux sondes HRMAS 1H/13C/15N et 1H/31P).
Avance 500 BRUKER équipé d’une cryosonde 5 mm inverse TCI 1H/13C/15N.
Waters XEVO TQS
Waters Synapt G2 HDMS
Thermo Exactive
Thermo Q-Exactive
Agilent 7000
Bruker Scion
GC/MS MS TQ8040 Shimazu avec Robot de préparation /injection
SMRI (AE et GC-C) Delta V Advantage Thermo Electron
AE-SMRI Sercon
LC-ESI-TripleQuad (Acquity UPLC-Xevo TQD (Waters))
LC-ESI-Q-TOF (Acquity UPLC-Synapt G2 HDMS Waters ))
GC-MS (1 HP5973N, 1 HP5975 Agilent Technologies)
GC-C-IRMS (Isoprime 100 Elementar) (configuration 13C et 15N)
MALDI TOF-TOF AuTOFLEX III Bruker Daltonics (Laser Smartbeam, Boite de collision (CID), LIFT).
un serveur hébergeant les banques de données pour l’identification de protéines.
LTQ-Orbitrap (Thermo)
Ultimate3000 (Dionex)
Nano-LC (Thermo)
Thermodésorbeur Unity2 + Passeur Ultra (Markes)
Automate SPE (Dionex)
Spectro IRMS (isotopes stables C/N) Deltaplus Thermo. Interface Conflo III, Analyseur élémentaire Flash EA 1112.
MALDI-TOF
Bruker Esquire 3000
Thermo Fisher TSQ Quantum Access
Compétences et ressources humaines
Les moyens humains rassemblés sur chacun des plateaux constitutifs de la plateforme correspondent à environ 25 eq. temps plein engagés par des personnels permanents et contractuels de niveaux techniciens, assistants ingénieurs et ingénieurs appliqués à des actions de réalisations techniques, de coordination, de traitements de données, de contrôle qualité.
Démarche qualité
Certains plateaux de CORSAIRE sont certifiés, d’autres en voie de le devenir. Un animateur est chargé d’assurer l’harmonisation du processus qualité.