Past training 2018


Ecoles chercheurs/Ateliers


Formation « 13C-fluxomique appliquée aux cellules cancéreuses »

FORMATION: 13C-FLUXOMIQUE APPLIQUÉE AUX CELLULES CANCÉREUSES
Cette formation a pour objectif l’acquisition de connaissances théoriques et pratiques de l’analyse des systèmes métaboliques par des approches de fluxomique appliquée au domaine du cancer.
- Date: du 13 au 16 nov. 2018
- Durée du stage : 4 jours – 30 heures
Plus de renseignement: Télécharger le fichier

Journées Lipidomystes

Journées Lipidomystes
Lieu: LYON
Date: 25 et 26 octobre 2018

Nous parlerons de préparation d'échantillons, de lipidomique globale, de traitement de données, de biophysique des membranes et de RMN...

Voici le lien pour vous inscrire : https://lipidomystes.sciencesconf.org/

Comme chaque année vous êtes les bienvenus pour faire des petites présentations techniques dans les thématiques proposées, n'hésitez pas à vous lancer!

Workshop "Analyse et interprétation des données en protéomique et métabolomique : points communs et spécificités"

Organisée conjointement par le R.F.M.F. - Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, la S.F.E.A.P. - Société Française d’Electrophorèse et Analyse Protéomique, ProFI - Infrastructure nationale de protéomique et MetaboHUB - Infrastructure nationale de métabolomique et fluxomique: https://www.forumlabo.com/ForumlaboLyon/conference.php
La protéomique et la métabolomique sont deux sciences "omiques" complémentaires pour l'étude du vivant et la médecine personnalisée, qui partagent notamment une technique analytique commune : la spectrométrie de masse. Nous sommes heureux de vous accueillir à ce workshop qui est constitué de deux parties visant à présenter un état de l'art sur l'analyse et l'interprétation des données dans chaque discipline, et à faire émerger des axes thématiques transverses. https://framaforms.org/workshop-analyse-et-interpretation-des-donnees-en-proteomique-et-metabolomique-points-communs-et

Date : Mercredi 28 mars 2018

Lieu : Forum Labo (Centre de congrès de Lyon)

HALLS 4/5/6 - ENTREE B
50 Quai Charles de Gaulle - 69463 Lyon cedex 06
Infos pratiques : https://www.forumlabo.com/ForumlaboLyon/infos.php

Intensive course at Tsukuba University (Japan) and Pontifical Catholic University of Chili

The following intensive course has been held on February 26th - March 2nd 2018 at Tsukuba University (Japan) and from March 22nd -March 27th 2018 at Pontifical Catholic University of Chili.

Subject name:Metabolomics: an emerging but powerful tool to study biology

Lecturer:Dr. Dominique Rolin (Professor, University of Bordeaux)

Credit:1.0 Credit

Room:F106 seminar room, Institute of Biological Agricultural Science building

Summary:In the post-genomics era, metabolomics represents a new «  omics tool » that in the last decade has received increased attention in many biological fields such as white and green biotechnology, nutrition, plant physiology, microbiology, etc. Metabolomics is based on the holistic study of the metabolic profile that characterizes a specific phenotype in a biological system. This course is going to give an overview on metabolomics approach in biology and will present the technological diversity to carry out metabolic. 

Lecture schedule:

26-Feb.    Introduction to functional genomic & metabolomics

27-Feb.    Metabolomics and its workflow

28-Feb.    NMR as analytical tool

1-Mar.      LC-MS and GC-MS as analytical tools

2-Mar       Examples of application

Toulouse School of Lipids 2018

La Toulouse School of Lipids s'est déroulée les 29-30 et 31 janvier 2018 en français.

L’objectif de cet enseignement est de donner aux participants les bases des connaissances sur les lipides, leur diversité, leurs biosynthèses et leurs rôles mais également de les familiariser avec les méthodes d’étude moderne de lipidomique. Les aspects les plus actuels de la recherche sur les grandes familles de lipides et leur implication en pathologie humaine seront abordés Télécharger le programme


e-MetaboHUB: W4M, MetExplore, NMRProcFlow, PeakForest


MetExplore Training Activity

Scope: international
Objective: The aim of this training is to provide theoretical background and hands on session on metabolomics data analysis in the context of metabolic pathways and networks. All the steps allowing to go from a list of metabolites to the extraction of a significant sub-network are addressed. Background on genome scale metabolic network and graph algorithms is provided to trainees.
Audience: Scientists interested in making sense of their metabolic profiles.
Number of participants: from 10 to 30.
Duration: Training can be adapted to last from 3 hours to 2 days.
Fees: depends on the training. www.metexplore.fr Contact: metexplore@toulouse.inra.fr
Support: MetaboHUB, RFMF

Training organised in 2018:
- EMBO Practical Course on Metabolomics Bioinformatics for Life Scientists: 5th-9th February 2018
- Metabolomics Workshop: From Study Design to Metabolite Annotation, Univ of Pretoria: 12th-16th March 2018
- Seminar and workshop, Univ of Ghent: 21st Septembre 2018
- Metabolomics course SIB, Lausanne: Decembre 3-4 2018

Training: Introduction to Metabolomics Analysis

 

This course will provide an introduction to metabolomics data analysis using publicly available software and tools. Participants will become familiar with the current state of experimental design, data standards, analysis and sharing in metabolomics, particuarly through using the EMBL-EBI's MetaboLights repository. There will be a large practical component, where participants will learn through hands-on tutorials to use a workflow-based approach and compute infrastructure for data analysis and data submission, under the guidance of the lecturers and teaching assistants.

Date:  Tuesday 20 March 2018 12:00 () - Friday 23 March 2018 14:00 ()

Venue: European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) - Wellcome Genome Campus, Hinxton, Cambridge,  CB10 1SD, United Kingdom

Workflow4Experimenters (W4E): Using Galaxy and the Workflow4metabolomics infrastructure to analyse your metabolomics data sets

Scope: international
Objective: Pre-processing, statistical analysis, and annotation of metabolomics data is a complex task. The Workflow4metabolomics online infrastructure provides a user-friendly and high-performance environment with advanced computational modules for building, running, and sharing complete workflows for LC-MS, GC-MS, and NMR analysis (Giacomoni et al, 2015)
Audience: LC-MS, GC-MS and NMR experimenters (e.g. biologists, chemists)
Number of participants: 25
Duration: 1 week
Fees: 900 € (academia) and 2000 € (industry)
Dates and place of the next session: 08- 12 October  2018, Pasteur Institute (Paris)
Programme: During this one-week course, participants will learn how to use the W4M infrastructure to analyze their own dataset. Morning sessions will be dedicated to methodology and tools. Afternoon sessions will be devoted to tutoring.
Contact: contact@workflow4metabolomics.org
Website: http://workflow4metabolomics.org/Support: IFB, MetaboHUB, RFMF, ELIXIR

Bilan de l’école « Workflow4Experimenters » qui s’est déroulé du 10 au 12 octobre à l’Institut Pasteur: Télécharger le fichier