Plateforme CORSAIRE Plateforme multi-sites GIS BIOGENOUEST

Nom des responsables de la structure

  • Alain Bouchereau, Prof. Univ. Rennes 1 Michel Krempf, Prof. Univ. Nantes

Tutelles de la structure

  • INRA , CNRS, Univ. Nantes, Univ. Rennes 1, Univ. Angers, Univ. Bretagne Occidentale, UPMC, Agrocampus Ouest, Oniris, INSERM

Personne référent pour les échanges avec MetaboHUB

  • Alain Bouchereau

Site géographique

  • Angers, Brest, Nantes, Rennes-Le Rheu, Roscoff

Adresse du site web

Domaine d’application

Mer, Agroressources, Santé, Environnement

Services types

Métabolomique, Profilages métaboliques ciblés et non ciblés, Analyses structurales, Fluxomique, Chimiométrie

Capacité analytique avec le type de techniques maitrisées

La plateforme CORSAIRE est en mesure de prendre en charge des prélèvements biologiques de natures diversifiées (fluides biologiques, gaz, tissus, extraits) d’origines biologiques variées (microbienne, animale, végétale) provenant d’environnements marin, terrestre, sauvage, d’élevage ou de culture. Les prestations proposées sont multiples : approches globales, approche ciblées, approches dynamiques (fluxomique).
La plateforme dispose des compétences nécessaires et de l’organisation adaptée pour assurer la prise en charge normalisée des demandes d’analyses, leur réalisation et la délivrance des rapports d’exécution.
Les compétences analytiques sont principalement basées sur la maîtrise de techniques extractives diversifiées (liquide, SPE, SPME,…) de techniques séparatives variées basées sur des systèmes de chromatographie liquides ou gazeuses et de techniques de détections variées (Vis, UV, Fluo, réfracto, spectrométrie de masse, RMN). Différentes configurations de spectromètres de masse à basse et haute résolutions sont disponibles. Les spectromètres de RMN sont de champs variables et équipés de sondes diversifiées.
CORSAIRE, en partenariat avec la plateforme ABIMS a contribué au développement des outils de retraitements des données sous Galaxy aussi bien pour la spectrométrie de masse que pour la RMN

Liste des équipements

Quelques-uns des principaux instruments disponibles sur la plateforme sont listés ci-après:

  • RMN , AVANCE III 500 BRUCKER
  • RMN , AVANCE 400 BRUCKER
  • RMN ASCEND 700 MHz BRUKER
  • DRX 300 BRUKER (sonde 5mm Quattro 1H/13C/31P/19F et sonde BBO 10 mm).
  • Avance 400 BRUKER (Dual 5 mm 1H/13C et sonde 5 mm inverse TBI 1H/{BB}/31P).
  • Avance III HD 500 BRUKER (sonde 5 mm inverse TBI 1H / {BB}/13C, sonde 5 mm inverse TXI 1H/13C/31P, sonde inverse 5 mm TXO 1H/19F/13C et deux sondes HRMAS 1H/13C/15N et 1H/31P).
  • Avance 500 BRUKER équipé d’une cryosonde 5 mm inverse TCI 1H/13C/15N.
  • Waters XEVO TQS
  • Waters Synapt G2 HDMS
  • Thermo Exactive
  • Thermo Q-Exactive
  • Agilent 7000
  • Bruker Scion
  • GC/MS MS TQ8040 Shimazu avec Robot de préparation /injection
  • SMRI (AE et GC-C) Delta V Advantage Thermo Electron
  • AE-SMRI Sercon
  • LC-ESI-TripleQuad (Acquity UPLC-Xevo TQD (Waters))
  • LC-ESI-Q-TOF (Acquity UPLC-Synapt G2 HDMS Waters ))
  • GC-MS (1 HP5973N, 1 HP5975 Agilent Technologies)
  • GC-C-IRMS (Isoprime 100 Elementar) (configuration 13C et 15N)
  • MALDI TOF-TOF AuTOFLEX III Bruker Daltonics (Laser Smartbeam, Boite de collision (CID), LIFT).
  • un serveur hébergeant les banques de données pour l’identification de protéines.
  • LTQ-Orbitrap (Thermo)
  • Ultimate3000  (Dionex)
  • Nano-LC (Thermo)
  • Thermodésorbeur Unity2 + Passeur Ultra (Markes)
  • Automate SPE (Dionex)
  • Spectro IRMS (isotopes stables C/N) Deltaplus Thermo. Interface Conflo III, Analyseur élémentaire Flash EA 1112.
  • MALDI-TOF
  • Bruker Esquire 3000
  • Thermo Fisher TSQ Quantum Access

Compétences et ressources humaines

Les moyens humains rassemblés sur chacun des plateaux constitutifs de la plateforme  correspondent à environ 25 eq. temps plein engagés par des personnels permanents et contractuels de niveaux techniciens, assistants ingénieurs et ingénieurs appliqués à des actions de réalisations techniques, de coordination, de traitements de données, de contrôle qualité.

Démarche qualité

Certains plateaux de CORSAIRE sont certifiés, d’autres en voie de le devenir. Un animateur est chargé d’assurer l’harmonisation du processus qualité.