La plateforme "Exploration du Métabolisme" (PFEM, Clermont-Ferrand) - Centre de Theix (INRA)

Nom des responsables de la structure

  • Estelle Pujos-Guillot

Tutelles de la structure

  • INRA

Personne référent pour les échanges avec MetaboHUB

  • Estelle Pujos-Guillot

Site géographique

  • Centre de Theix (INRA)

Adresse du site web

Domaine d’application

Nutrition, Santé

Services types

La plateforme met à disposition des moyens techniques et humains pour la réalisation de projets scientifiques d’étude du métabolisme. De plus, elle propose le développement de nouveaux outils pour répondre à de nouvelles problématiques scientifiques, enjeux actuels du domaine: développement d’approches multi-plateformes pour l’obtention d’une couverture analytique maximale du métabolome, développement de stratégies analytiques pour faciliter l’identification des biomarqueurs et la réalisation d’outils d’automatisation du traitement des données (workflows et bases de données).
La plate-forme dispose de locaux réservés à l'accueil temporaire des utilisateurs extérieurs, et propose régulièrement des actions de formation.
 

Capacité analytique avec le type de techniques maitrisées

La plateforme accueille chaque année plus de 30 projets par an, ce qui représente environ 7 000 échantillons analysés.

Liste des équipements

-Activité métabolomique non ciblée :
Profilage métabolique : LC/QToF,  GC/QToF, LC / RMN / ToF metabolic profiler,
Identification de métabolites inconnus : LTQ Orbitrap
-Activité quantification : LC/QqQ, GC/QqQ
-Activité fluxomique : GC/MS, GC/C/IRMS
-Workflow bioinformatique:
Workflow4Metabolomics (W4M) :http://workflow4metabolomics.org/
-Bases de données:
PeakForest: https://peakforest.org/
Phytohub : http://phytohub.eu/

Compétences et ressources humaines

L'équipe de la plateforme comporte 22 personnes titulaires dédiées (16,3 E.T.P.) à son fonctionnement et dont les compétences incluent la biochimie, la chimie analytique, les statistiques et la bioinformatique

Démarche qualité

Certification ISO 9001 et NFX 50-900
Depuis 2009, nous sommes également labélisés « plateforme d’excellence » par le GIS IBiSA