l’Institut Français de Bioinformatique (IFB)

Nom des responsables de la structure

  • Erwan Corre

Tutelles de la structure

  • CNRS UMS 3601

Personne référent pour les échanges avec MetaboHUB

  • Etienne Thévenot

Site géographique

  • Place Georges Teissier - Station Biologique de Roscoff 29680 Roscoff

Adresse du site web

Domaine d’application

Environnement
Biologie
Agro-alimentaire

Services types

ABiMS travaille avec des équipes de recherche dans le cadre de la collaboration scientifique formalisée.
 
ABiMS offrent des services différents:
• Un environnement de calcul scientifique (Infrastructure As A Service - IAAS)
• Conseil et expertise en 'analyse des données omiques
• ingénierie en logiciel (système d'information, bases de données, ...)
• Prise en charge de l'utilisateur et formation
 
L'offre de formation repose sur des modules de formation d'initiation aux environnements (Linux, Cluster, etc.), d'utilisation des outils (Galaxy, etc.) et langages (PERL, R, etc.), et de compréhension des méthodes (RNA-seq, Analyses statistiques, etc.). ABiMS est également en mesure de proposer des formations à façon pour des communautés (e.g. Métabolomique) ou des projets (École thématique).

Liste des équipements

•1 serveurs BDD (MysQL + PostreSQL)
•1 serveur R
•10 serveurs WEB
•3 serveurs Galaxy pour la production (NGS, Metabolomics et Public)
•1 serveur de développement Galaxy
•56 nœuds de calculs
•1 serveur maître
•4 serveurs NFS

Démarche qualité

ISO 9001