Plateforme Métabolome Bordeaux (BMP)

Nom des responsables de la structure

  • Annick Moing

Tutelles de la structure

  • INRA, Université de Bordeaux, CNRS

Personne référent pour les échanges avec MetaboHUB

  • Annick Moing

Site géographique

  • Centre INRA de Bordeaux, Site de Villenave d'Ornon, IBVM CS20032 33140 Villenave d'Ornon

Adresse du site web

Domaine d’application

Plantes et produits issus de plantes

Services types

La Plateforme Métabolome Bordeaux est ouverte à l'ensemble de la communauté pour la mise à disposition de services, d’équipements et d'expertise.
Elle propose des services ou collaborations pour l’acquisition et l’interprétation de profils métabolomiques ou lipidomiques, l’identification et/ou l’analyse de métabolites (RMN et MS), et la mesure d’enrichissements isotopiques. Les autres activités de la Plateforme concernent la formation et les développements technologiques.
En collaboration avec PHENOME, la Plateforme Métabolome Bordeaux développe des méthodes d’extraction robotisée.
En collaboration avec la Plateforme de Bioinformatique de Bordeaux, elle a développé MeRy-B (http://bit.ly/meryb) une Base de Données et de Connaissances Métabolome dédiée aux plantes.
La Plateforme Métabolome Bordeaux a développé NMRProcFlow (www.nmrprocflow.org) une application web pour le retraitement des spectres RMN, et BioStatFlow (biostatflow.org/) une application web pour les analyses statistiques de données omiques dont les données métabolomiques.

Capacité analytique avec le type de techniques maitrisées

La Plateforme Métabolome Bordeaux réalise plus de 20 000 analyses métabolomiques ou lipidomiques pour plus de 100 projets par an.
Techniques : RMN 1D et multidimensionnelle des liquides, LC-RMN, LC/LC-MS, GC/GC-MS, HPTLC.

Liste des équipements

Spectromètre de RMN 500 MHz et son environnement (2001, 2010)
Spectromètre de RMN 600 MHz (2008) et son environnement dont une sonde LC-RMN (2008)
Chaîne LC-MS QqTOF (2007)
Chaîne LC-MSn ion trap (2007, 2014)
Chaîne GC-MS (2006, 2017)
Chaînes LC-Qtrap-MS (2017)
Chaîne UHPLC-LTQ-Orbitrap-MS (2014)
Systèmes robotisés de phénotypage métabolique à haut débit en microplaques (2009-2014, PHENOME)

Compétences et ressources humaines

La Plateforme Métabolome Bordeaux fonctionne grâce à la présence d’une vingtaine de permanents de l’INRA, du CNRS ou de l’Université de Bordeaux y travaillant à temps plein ou partiel. Plusieurs CDD des projets IA MetaboHUB et PHENOME contribuent aux développements technologiques.
Les compétences des membres sont complémentaires et incluent biologie, biochimie, chimie, bioinformatique, et biostatistiques.

Démarche qualité

La Plateforme Métabolome Bordeaux est labellisée IBiSA (depuis 2008) et Plate-forme Stratégique Nationale INRA (2008 et 2013)
Son système de Management de la Qualité a été certifié ISO 9001:2008 par l'organisme LRQA de 2013 à 2015, et se base actuellement sur ce référentiel.