BIOMET (académique)/CRIBIOM (commercial)

Nom des responsables de la structure

  • Jean-Charles Martin

Tutelles de la structure

  • Aix-Marseille Université

Personne référent pour les échanges avec MetaboHUB

  • Jean-Charles Martin

Site géographique

  • Faculté de Médecine La Timone, Marseille

Adresse du site web

Domaine d’application

Santé, nutrition, agro-alimentaire

Services types

  • L’aide au design expérimental (conseil scientifique),
  • La réalisation de protocoles d’essais sur animaux (souris) ou cultures cellulaires (lignées/primo-cultures),
  • La réalisation d’analyses biologiques de type « omique » (métabolomique par spectrométrie de masse, transcriptomique par microarrays et qPCR), spécifiques (profilage d’acides gras, qPCR, identifications de composés inconnus par spectrométrie de masse basse et haute résolution), et classiques (tests colorimétriques, ELISA, etc.),
  • Le développement de nouvelles méthodes permettant d’atteindre les objectifs fixés,
  • La rédaction de rapports décrivant les méthodes, les résultats et une interprétation des résultats sur la base des prestations définies dans le cahier des charges,
  • Des statistiques complémentaires avancées avec l’interprétation biologique, en lien avec le partenaire MS Nutrition.

Capacité analytique avec le type de techniques maitrisées

Métabolomique non ciblée de métabolites polaires en mode LC-spectrométrie de masse haute résolution et GC-MS basse résolution, quantification par spectrométrie de masse LC/MS, profilage à haut débit d’acides gras par GC-FID ultra-rapide, lipidomique non ciblée par LC-MS/MS

Liste des équipements

  • 1 LC Agilent 1200-ESI-microTOFQ Bruker,
  • 1 LC Dionex 3000-ESI/APCI-Q-Exactive+ ThermoFinnigan,
  • 1 GC/MS Agilent 5970,
  • 1 GC-FID Perkin-Elmer ultra-fast,
  • 1 banque de donnée maison (MS et MS/MS) de plus de 600 composés avec infrastructure informatique de gestion,
  • 1 serveur de stockage/calcul

Compétences et ressources humaines

  • 1 ingénieur spectrométrie de masse (CDI CRIBIOM),
  • 1 chercheur contractuel métabolomicien (analyses MS, stat, interprétation biologique),
  • 1 maitre de conférence métabolomicien,
  • 1 chargé d’études physiologie/transcripto mique/métabolomique (CDI CRIBIOM),
  • 1 directeur de Recherches métabolomicien (fouillage de données, modélisation).
  • A cette équipe s’adjoint la start’up « MS Nutrition » pour la réalisation d’études statistiques avancées (https://www.linkedin.com/in/matthieu-maillot-4b135074), ainsi que 3 thésards.

Démarche qualité

Nous allons nous engager dans cette démarche à partir de 2016